悬式绝缘子有些增强子位于启动子上游,有些位于下游,所以绝缘子的效应并不取决于绝缘子同启动子的相对位置.因此,对绝缘子效应的方向性的原因还没有弄清晰.目前已发现有两个基因座以反式活化方式影响绝缘子的功能.
基因S2J(Hw)编码的核蛋白识别绝缘子,绝缘子同其结合后才有绝缘作用.当该基因突变后,尽管y基因座中插入了绝缘子,但失去了绝缘作用,y在所有组织中都表达.另一个基因座是mod(mdg 4),该基因发生突变后,其效应正好与Su(Hw)相反,即这些突变型都增强了绝缘作用,使绝缘子的绝缘效应不再有方向性而扩展,也就是阻断了上游和下游两侧的增强子的效应.有一种解释以为先是Su(Hw)同绝缘子DNA结合后,使绝缘子有绝缘效应.mod(mdg4)同Su(Hw)结合,使绝缘子失去绝缘效应；突变的mod(mdg4)不能同Su(Hw)结合,于是绝缘子又增强了绝缘作用.